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　　云南省農業(yè)科學院生物技術與種質資源研究所（以下簡稱“生物所”）建于2004年6月，其前身是創(chuàng)建于1986年的云南省遺傳工程研究室（“遺傳室”）、云南省農業(yè)科學院分析測試中心（“測試中心”），以及1988年建立的云南省農業(yè)科學院品種資源站（“品資站”）。1992年，遺傳室與測試中心合并成立云南省農業(yè)科學院生物技術研究所，同年，經(jīng)云南省人民政府批準，依托云南省農業(yè)科學院，在所內建設云南省農業(yè)生物技術重點實驗室，1994年建成并通過驗收，是我國地方農科院系統(tǒng)最早成立的農業(yè)生物技術研究機構之一。1998年底，經(jīng)云南省人民政府省院省校合作辦公室批準，與北京大學植物基因工程與蛋白質工程國家重點實驗室合作共建“北京大學--云南省農業(yè)生物技術聯(lián)合實驗室”。2002年經(jīng)考核評估，被命名為“農業(yè)部南方高原農業(yè)生物技術重點開放實驗室”。2004年，云南省農業(yè)科學院進行學科結構調整，生物技術所與品資站合并成立云南省農業(yè)科學院生物技術與種質資源研究所。
　　研究所和重點實驗室不斷凝煉優(yōu)化學科方向，目前主要有作物種質資源、農作物生物技術育種、應用植物病毒三大學科方向，建設農業(yè)生物資源與農業(yè)生物技術兩大平臺，是我國南方高原地區(qū)特色農業(yè)生物資源的生物技術研究、開發(fā)、國內外合作交流及人才培養(yǎng)基地。建有國家人事部博士后科研工作站，與云南大學等單位合作的國家生命科學和技術人才培養(yǎng)基地，共建云南大學生物化學與分子生物學博士點和碩士點。與云南大學植物學、細胞生物學、微生物學、生物工程專業(yè)，云南農業(yè)大學作物遺傳育種專業(yè)，昆明理工大學生物工程學院微生物、植物學、生物化學與分子生物學專業(yè)、中國農業(yè)科學院研究生院、華中農業(yè)大學、大理學院等聯(lián)合招收碩士研究生，與中國科學院昆明植物所聯(lián)合培養(yǎng)博士及碩士研究生。與美國內華達州立大學Jeff Shen實驗室合作共建聯(lián)合實驗室，與明技科技有限公司共建美國Backman Culter公司基因測序聯(lián)合實驗室，與美國阿拉斯加大學、康奈爾大學、德州農工大學，意大利國際植物遺傳資源研究所，法國國際農業(yè)研究中心（CIQAD），法國聯(lián)邦作物科學中心，韓國農村振興廳（RDA），越南國家農業(yè)科學院等機構開展了合作研究項目。